長野県木曽地域（木曽郡）を中心に飼育されている日本在来種。岐阜県飛騨地方でも飼育されている。一時絶滅寸前であったが、木曽馬保存会が中心に活動が行なわれた結果、飼育数は増加した。しかし、以前のような乗用、農耕を目的とした需要はなく、現在は200頭以下という。平安時代～江戸時代、武士の馬として使用された。体高は、およそ133～136cm。体重350kg～420kg。短足胴長であり、体幅が広い。性格はおとなしいといわれている。山間部で飼育されていた為、足腰が強く、頑強である。